MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 6840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021883	AGG	2	6	423031	423036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021883	AAT	2	6	424805	424810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021883	TGA	2	6	424854	424859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021883	GAA	2	6	424862	424867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021883	AAT	2	6	424868	424873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021883	TCTA	2	8	424878	424885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_021883	TTAT	2	8	424895	424902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021883	CT	3	6	424903	424908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_021883	CT	3	6	424917	424922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_021883	T	7	7	424967	424973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021883	ACT	2	6	425014	425019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021883	ATA	2	6	425032	425037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021883	T	6	6	426994	426999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021883	A	6	6	428016	428021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021883	TTA	2	6	428039	428044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021883	AAT	2	6	428990	428995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021883	ATG	2	6	429017	429022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021883	TAT	2	6	429140	429145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021883	A	6	6	429154	429159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021883	GGA	2	6	430721	430726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021883	A	6	6	430726	430731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021883	T	7	7	430770	430776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021883	TG	3	6	430834	430839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021883	AATA	2	8	431562	431569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021883	T	6	6	431599	431604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021883	AGAT	2	8	431792	431799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1030	NC_021883	TC	4	8	432589	432596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_021883	AATA	2	8	432704	432711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021883	A	6	6	435636	435641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021883	AT	3	6	435667	435672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021883	GTA	2	6	435686	435691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1036	NC_021883	ATG	2	6	435728	435733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021883	TTA	2	6	436420	436425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021883	CAAATA	2	12	436429	436440	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1040	NC_021883	ATTTA	2	10	439037	439046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021883	TAA	2	6	439058	439063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021883	T	6	6	441154	441159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021883	GAT	2	6	441160	441165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1045	NC_021883	TAA	2	6	441240	441245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021883	A	7	7	441272	441278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021883	T	7	7	441293	441299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021883	T	6	6	441302	441307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021883	AATTC	2	10	445250	445259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1051	NC_021883	ATG	2	6	445369	445374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021883	CTTTT	2	10	445385	445394	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_021883	TC	3	6	445401	445406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_021883	T	6	6	445409	445414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021883	ATT	2	6	448391	448396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_021883	GCCC	2	8	450683	450690	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1062	NC_021883	ATA	2	6	450697	450702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1064	NC_021883	TAT	2	6	452466	452471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021883	TTA	2	6	452477	452482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021883	GAT	2	6	452487	452492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021883	GGGAA	2	10	452527	452536	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021883	AGA	2	6	452545	452550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021883	A	6	6	452581	452586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_021883	TAC	2	6	452627	452632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1074	NC_021883	A	7	7	454319	454325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_021883	A	6	6	464021	464026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1103	NC_021883	TGAA	2	8	466161	466168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021883	TAC	2	6	466205	466210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1107	NC_021883	AAG	2	6	466461	466466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021883	A	7	7	466481	466487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021883	A	7	7	466530	466536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021883	TTTA	2	8	466583	466590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1116	NC_021883	GA	3	6	467578	467583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021883	TCA	2	6	469386	469391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1119	NC_021883	TAT	2	6	469756	469761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1121	NC_021883	ACT	2	6	469779	469784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1126	NC_021883	TAA	2	6	473746	473751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_021883	TTC	2	6	478836	478841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021883	AGA	2	6	478846	478851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021883	AAG	2	6	478869	478874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021883	TGA	2	6	478879	478884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_021883	TC	4	8	478939	478946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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